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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia; Embrapa Solos. |
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Data corrente: |
20/09/2021 |
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Data da última atualização: |
25/08/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PEIXOTO, R. S.; COUTINHO, H. L. da C.; RUMJANEK, N. G.; MACRAE, A.; ROSADO, A. S. |
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Afiliação: |
R. S. PEIXOTO, UFRJ; HEITOR LUIZ DA COSTA COUTINHO, CNPS; NORMA GOUVEA RUMJANEK, CNPAB; A. MACRAE, UFRJ; A. S. ROSADO, UFRJ. |
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Título: |
Use of rpoB and 16S rRNA genes to analyse bacterial diversity of a tropical soil using PCR and DGGE. |
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Ano de publicação: |
2002 |
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Fonte/Imprenta: |
Letters in Applied Microbiology, v. 35, n. 4, p. 316-320, Oct. 2002. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1046/j.1472-765X.2002.01183.x |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Aim: To evaluate the rpoB gene as a biomarker for PCR-DGGE microbial analyses using soil DNA from the Cerrado, Brazil. Methods: DNA extraction from soil was followed by Polymerase Chain Reaction (PCR) amplification of rpoB and 16S rRNA genes. PCR products were compared by Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE) to compare gene/community profiles. Results: The rpoB DGGE profiles comprised fewer bands than the 16S rDNA profiles and were easier to delineate and therefore to analyse. Comparison of the community profiles revealed that the methods were complementary. Conclusions, Significance and Impact of the Study: The gene for the beta subunit of the RNA polymerase, rpoB, is a single copy gene unlike 16S rDNA. Multiple copies of 16S rRNA genes in bacterial genomes complicate diversity assessments made from DGGE profiles. Using the rpoB gene offers a better alternative to the commonly used 16S rRNA gene for microbial community analyses based on DGGE. |
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Palavras-Chave: |
DNA extraction. |
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Thesaurus Nal: |
Polymerase chain reaction; Tropical soils. |
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Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Solos (CNPS) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
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Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 6 | |
| 1. |  | BATISTA, N. J. M.; OLIVEIRA, D. de S.; ROGERIO, M. C. P.; BONFIM, J. M.; MOURA, J. W. F.; MELO, J. C. R.; ALBUQUERQUE, F. H. M. A. R. de; ARAÚJO, A. R. de. Desempenho de cordeiros de dois grupos genéticos terminados em confinamento no Semiárido nordestino. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 7.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 13., 2012, Maceió. Anais... Maceió: Sociedade Nordestina de Produção Animal, 2012. 3 f. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 2. | | BATISTA, N. J. M.; ROGERIO, M. C. P.; ARAÚJO, A. R.; BOMFIM, J. M.; MOURA, J. W. F.; MELO, J. C. R. Consumo de cordeiros de diferentes grupos genéticos alimentados com silagem de sorgo forrageiro, oriundo de área adubada com nitrogênio. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CAPRINOS E OVINOS, 2., 2013, Sobral. Resumos... Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2013. p. 34-35. (Embrapa Caprinos e Ovinos. Documentos, 109).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 3. | | DUTRA, M. de S.; MAGALHÃES, Y. A.; GONÇALVES, J. de L.; MARTINS, F. E. B.; COSTA, H. H. A.; MELO, J. C. R.; BOMFIM, M. A. D. Consumo e digestibilidade da proteína bruta por pequenos ruminantes alimentados com pasto nativo da Caatinga do estrato herbáceo ou arbóreo. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 12., 2017, Juazeiro, BA. Construindo pontes entre o ensino, a pesquisa e a extensão: anais. Petrolina: Univasf: Embrapa Semiárido: Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia, Sertão de Pernambuco, 2017. 1 CD-ROM. p. 957-958.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 5. | | SILVA, S. P. da; MELO, J. C. R.; GUEDES, F. L.; DUTRA, M. de S.; SOUSA, Y. H. L. de; BOMFIM, M. A. D. Análise bromatológica do feijão guandu para predição da composição química para o uso nos modelos de calibração do NIRS. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CAPRINOS E OVINOS, 6., 2017, Sobral. Anais... Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2017. p. 31-32.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 6. | | SOUSA, Y. H. L. de; MELO, J. C. R.; GUEDES, F. L.; DUTRA, M. de S.; SILVA, S. P. da; BOMFIM, M. A. D. Análise exploratória do feijão guandu (Cajanus cajan) por meio da espectroscopia de reflectância na região do infravermelho próximo (NIRS). In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CAPRINOS E OVINOS, 6., 2017, Sobral. Anais... Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2017. p. 37-38.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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